MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 12637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017338	TA	3	6	1391	1396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017338	TAA	3	9	1404	1412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017338	T	6	6	1419	1424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017338	AC	3	6	1491	1496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017338	CCA	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017338	CTA	3	9	1572	1580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017338	TA	3	6	1600	1605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017338	TA	4	8	1608	1615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017338	ATAAAT	2	12	2776	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017338	ATTA	2	8	2801	2808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017338	T	6	6	2824	2829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017338	AAT	2	6	2836	2841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017338	AAAT	2	8	2858	2865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017338	TAA	2	6	2931	2936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017338	TTTAAA	2	12	2953	2964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017338	CGT	2	6	3004	3009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017338	A	6	6	3021	3026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017338	A	6	6	3047	3052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017338	AATT	2	8	3057	3064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017338	A	7	7	3113	3119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017338	AT	3	6	3126	3131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017338	ATT	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017338	TGAAC	2	10	6459	6468	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017338	AGG	2	6	6475	6480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017338	AT	3	6	10097	10102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017338	TAT	2	6	10122	10127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017338	ATT	2	6	10142	10147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017338	ATT	2	6	10208	10213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017338	ACA	2	6	10224	10229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017338	ATA	2	6	10267	10272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017338	AAG	2	6	10327	10332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017338	AAGT	2	8	11893	11900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017338	TAA	2	6	11953	11958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017338	AT	3	6	11981	11986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017338	AG	3	6	12000	12005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017338	AT	4	8	12034	12041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017338	CTAC	2	8	12046	12053	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017338	T	7	7	12184	12190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017338	A	6	6	12198	12203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017338	ACGT	2	8	12209	12216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017338	ATA	2	6	12223	12228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017338	ATT	2	6	12236	12241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017338	TA	3	6	13574	13579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017338	ATA	2	6	13616	13621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017338	GTG	2	6	13631	13636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017338	T	7	7	13653	13659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017338	AAC	2	6	13695	13700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017338	CAA	2	6	13748	13753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017338	CAT	2	6	13805	13810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017338	AGGAA	2	10	13817	13826	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017338	GTA	2	6	13852	13857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017338	GTAGG	2	10	13875	13884	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017338	G	6	6	13883	13888	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017338	ATG	2	6	13889	13894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017338	TCA	2	6	13932	13937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017338	A	6	6	13946	13951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017338	AAC	2	6	13972	13977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017338	TAAA	2	8	14009	14016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017338	A	6	6	14014	14019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017338	TAT	2	6	14142	14147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017338	T	6	6	14147	14152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017338	TA	3	6	14159	14164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017338	AGG	2	6	14180	14185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017338	AAC	2	6	15354	15359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017338	TCA	2	6	15381	15386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017338	CTT	2	6	15525	15530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017338	T	7	7	15552	15558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017338	AGG	2	6	15564	15569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017338	TA	3	6	16552	16557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017338	TAAATC	2	12	16636	16647	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017338	AAT	2	6	16675	16680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017338	CA	3	6	16698	16703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017338	TTA	2	6	16749	16754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017338	ATA	2	6	16818	16823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017338	AAT	2	6	21652	21657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017338	AT	3	6	21707	21712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017338	TA	3	6	23202	23207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017338	AGG	2	6	23256	23261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017338	TCGAT	2	10	23285	23294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017338	GAT	2	6	23355	23360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017338	AAG	2	6	23395	23400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017338	A	6	6	23466	23471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017338	ATT	2	6	23487	23492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017338	ATA	2	6	23493	23498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017338	TTC	2	6	23538	23543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017338	A	6	6	23544	23549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017338	A	6	6	23567	23572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017338	ATCT	2	8	23605	23612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017338	CGG	2	6	23663	23668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017338	T	6	6	23701	23706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017338	GCCT	2	8	23733	23740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017338	T	7	7	23809	23815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017338	TTTA	2	8	23886	23893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017338	T	6	6	23954	23959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017338	ACC	2	6	23969	23974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017338	TATT	2	8	23977	23984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017338	CTT	2	6	23991	23996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017338	ATA	2	6	24034	24039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017338	TATT	2	8	24041	24048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017338	T	7	7	24079	24085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017338	ATT	2	6	24139	24144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017338	TAA	2	6	24167	24172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017338	A	6	6	24171	24176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017338	AT	3	6	24182	24187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017338	TA	3	6	24233	24238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017338	T	6	6	24307	24312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017338	A	6	6	24337	24342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017338	ATA	2	6	24350	24355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017338	ATA	2	6	29051	29056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017338	GTG	2	6	29089	29094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017338	AGT	2	6	29169	29174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017338	TAA	2	6	29239	29244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017338	ATA	2	6	29313	29318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017338	CTG	2	6	30259	30264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017338	GAC	2	6	30268	30273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017338	T	6	6	30286	30291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017338	TGT	2	6	30293	30298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017338	TGG	2	6	30299	30304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017338	TGT	2	6	30312	30317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017338	TTGA	2	8	30332	30339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017338	A	6	6	30345	30350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017338	AAT	2	6	30377	30382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017338	ATCA	2	8	30392	30399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017338	ATA	2	6	30419	30424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017338	AT	3	6	32778	32783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017338	TAC	2	6	32793	32798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017338	T	7	7	32829	32835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017338	A	6	6	32840	32845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017338	TAA	2	6	32889	32894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017338	A	7	7	33050	33056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017338	TAA	2	6	33064	33069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017338	TAA	2	6	33091	33096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017338	GGA	2	6	33129	33134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017338	T	6	6	33629	33634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017338	AAG	2	6	33706	33711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017338	TTTCA	2	10	33765	33774	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017338	ATA	2	6	33780	33785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017338	TTCT	2	8	33844	33851	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017338	ATAA	2	8	33882	33889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017338	GAA	2	6	33899	33904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017338	ATA	2	6	33913	33918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017338	AGG	2	6	33930	33935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017338	TAAAA	2	10	35218	35227	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017338	TAA	2	6	35236	35241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017338	TAAA	2	8	35259	35266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017338	A	6	6	35290	35295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017338	T	6	6	35347	35352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017338	AGATA	2	10	35376	35385	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017338	TAA	2	6	35391	35396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017338	A	6	6	35401	35406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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